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Por qué es importante saber cómo nació la variante Ómicron

Dos científicos estadounidenses rastrearon el árbol genealógico del nuevo linaje del coronavirus. Advirtieron sobre qué controles son necesarios para evitar nuevas mutaciones

La variante Ómicron podría ser rastreada hasta su origen (REUTERS/Dado Ruvic)

La variante Ómicron del coronavirus es “altamente transmisible” y requiere una “acción urgente”, afirmaron las voces sanitarias del mundo ante la aparición de una nueva mutación del SARS-CoV-2.

Concretamente, Ómicron tiene 50 mutaciones, 32 de las cuales se encuentran en la proteína S, que sirve de llave de acceso a las células humanas.

Mientras la comunidad científica se apura en comprobar su contagiosidad, mortalidad y efectividad para evadir las vacunas, otra parte de los investigadores y las autoridades gubernamentales de los principales países del mundo se preguntan ¿cómo surgió esta nueva variante?

Ómicron tiene 50 mutaciones, 32 de las cuales se encuentran en la proteína S (Getty)              Ómicron tiene 50 mutaciones, 32 de las cuales se encuentran en la proteína S (Getty)

Una de las herramientas clave que utilizan los científicos para descifrar el origen de una variante particular del coronavirus es observar su código genético. Al igual que una persona que quiere averiguar su ascendencia y mediante el rastreo de un linaje particular en sus genes puede darle la respuesta, el genoma del virus también contiene pistas que llevan a desentrañar su verdadero origen.

Ha sido muy común usar un árbol evolutivo, o un árbol genealógico, de estos virus SARS-CoV-2 para detectar introducciones en lugares como Australia y Taiwán que no han tenido mucha propagación local”, afirmó a NPR Trevor Bedford, virólogo computacional y profesor en el Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson en Seattle. “Puede averiguar de dónde provienen las importaciones observando el genoma viral y comprobando: ‘¿Se acerca en sus características de secuencia a [cepas] que están circulando en otros lugares que han sido secuenciadas y compartidas con la base de datos?’ “, agregó.

A continuación, los científicos pueden observar, a medida que continúan tomando muestras en la nueva región a lo largo del tiempo, cómo cada variante en particular comienza a detectar mutaciones adicionales, a menudo benignas, paso a paso hasta que se transforma en una cepa significativamente diferente. Pero Bedford dice que cuando miras el árbol genealógico de esta variante Ómicron, hay algo sorprendente: “Las secuencias más cercanas son de mediados de 2020, es decir, hace más de un año. Eso es muy raro de ver”.

En otras palabras, si bien los científicos pueden decir que esta variante evolucionó a partir de una cepa que circulaba a mediados de 2020, en los meses intermedios no ha habido rastros de todas las versiones intermedias que los investigadores habrían esperado encontrar a medida que se transformó en su forma actual. “No se relaciona con nada que estuviera circulando más recientemente. Sin embargo, sus mutaciones lo sitúan muy lejos de esa cepa de 2020″, destacó.

Una enfermera hace una PCR buscando la variante Ómicron (EFE/EPA/YURI KOCHETKOV)

¿Cómo se explica esto?

Hipótesis # 1: La fuente animal

Según Bedford, la cepa de mediados de 2020 pudo haber infectado a una población animal desconocida, y luego haya evolucionado a medida que se propagó entre ellos y recientemente se haya dispersado nuevamente a los humanos. Pero el experto cree que es poco probable que la hipótesis sea cierta: “Esto se está volviendo técnica Pero la esencia es que uno esperaría ver signos del material genético del animal en el genoma y, en cambio, hay una inserción de ARN humano que a lo largo de la rama [evolutiva de Ómicron], estaba evolucionando en un humano”.

Hipótesis # 2: “Propagación críptica” en una región no monitoreada

La segunda posibilidad, dice Bedford, es que la cepa de mediados de 2020 comenzó a circular en un lugar donde no ha habido mucho seguimiento, “quizás en algún lugar del sur de África”. Eso permitiría que el virus evolucionara fuera del radar durante todo este tiempo. “Y, finalmente, para cuando llegas a 2021, ha detectado suficientes mutaciones que se han vuelto [mucho más] transmisibles y luego explotan en la escena en ese momento”, hipotiza Bedford.

El genoma del virus también contiene pistas que llevan a desentrañar su verdadero origen (NIH)        El genoma del virus también contiene pistas que llevan a desentrañar su verdadero origen (NIH)

Pero también encuentra que ese escenario, al que los científicos a veces se refieren como “propagación críptica”, es difícil de creer. “Porque si pareciera que como [esta cepa del virus] estaba en camino de convertirse en Ómicron y convertirse en un virus bastante transmisible, [las versiones anteriores] habrían comenzado a propagarse más ampliamente hace un momento”. Y en ese momento se habría notado en países que sí tienen sistemas de vigilancia robustos.

Su colega Richard Lessells es un especialista en enfermedades infecciosas de la Universidad de KwaZulu-Natal en Durban, Sudáfrica, y parte del equipo que identificó Ómicron en Sudáfrica y alertó al mundo. Lessells está de acuerdo. Por un lado, señala que ciertamente hay países en África donde no ha habido muchas muestras en curso del coronavirus. De hecho, dice, anteriormente en la pandemia, los laboratorios de Sudáfrica detectaron una variante que no se había visto antes en un viajero de Tanzania, uno de varios países del África subsahariana “donde no estaban midiendo muy bien la epidemia”.

Ahora, esa variante nunca despegó realmente en ningún área. Y todavía no sabemos hasta qué punto estaba circulando en Tanzania y cuál era su significado. Pero esos episodios en realidad ilustran que una vez que una variante llega a Sudáfrica, al menos, es menos probable que se identifique. Tenemos 7 centros de secuenciación [genómica] que están conectados a los laboratorios de diagnóstico públicos y privados en todo el país”, señala.

La variante Ómicron fue detectada por primera vez en Sudáfrica (REUTERS/Dado Ruvic/Illustration/File Photo)

Hipótesis # 3: Incubación en una persona inmunodeprimida

Sin embargo, hay un lugar que el virus podría usado como escondite mientras que se desarrolló en Ómicron y que ha funcionado como un punto ciego para los funcionarios de la salud: en el interior del cuerpo de una sola persona. Específicamente, una persona cuyo sistema inmunológico estaba inhibido, por ejemplo, como resultado de una infección por el VIH no tratada.

En tales casos, explica Bedford, el sistema inmunológico de la persona todavía es lo suficientemente fuerte como para evitar que el coronavirus la mate. Pero no es lo suficientemente fuerte como para eliminar completamente el virus. Por lo tanto, el virus permanece dentro de la persona durante un mes tras otro, reproduciéndose continuamente. Con cada replicación, existe la posibilidad de que adquiera una mutación que mejore su capacidad para evadir las células inmunitarias productoras de anticuerpos de la persona.

Crea este tipo de juego del gato y el ratón en el que la respuesta inmune persigue y el virus se ejecuta. Y así, a lo largo del año, si miras a estos individuos, ves, al final de ese tiempo, generalmente un virus bastante evolucionado”, dice Bedford.

Científicos prueban la efectividad de las vacunas contra la nueva variante (REUTERS/Alexandre Meneghini/File Photo)Científicos prueban la efectividad de las vacunas contra la nueva variante (REUTERS/Alexandre Meneghini/File Photo)

Lessells es uno de varios investigadores que han demostrado este fenómeno al analizar retroactivamente una serie de muestras del coronavirus que se tomaron durante un período de aproximadamente seis meses a una mujer que tenía VIH. A través de una desafortunada serie de contratiempos no deseados en su atención médica, más tarde se supo que no estaba siendo tratada adecuadamente por su infección por VIH durante ese tiempo, incluso cuando estaba inscrita en un estudio más grande para el cual se estaban tomando muestras del coronavirus que ella albergado.

“Debido a que teníamos muestras de algunos puntos de tiempo diferentes durante ese período de seis meses, pudimos mostrar cómo evolucionó el virus y las variantes con algunas de las mismas mutaciones que las variantes de interés aparecieron con el tiempo en las muestras”, precisó el experto. Si así es como se creó Ómicron, entonces presumiblemente no fue hasta hace relativamente poco que el virus finalmente se propagó a otros de la persona que lo estaba incubando.

¿Por qué no habría ocurrido esta propagación en puntos anteriores durante la evolución de Ómicron en el cuerpo del individuo inmunodeprimido? “Esa es una buena pregunta y legítima. No tengo una respuesta obvia además del azar”. Igual que Lessells, actualmente considera que este escenario es la explicación más plausible del surgimiento de ómicron”, concluyó Bedford.

Una trabajadora de la Salud vacuna a una mujer contra la covid-19 en Tegucigalpa (Honduras), EFE/Gustavo Amador Una trabajadora de la Salud vacuna a una mujer contra la covid-19 en Tegucigalpa (Honduras), EFE/Gustavo Amador

Independientemente de los orígenes de Ómicron, Bedford y Lessells dicen que su aparición es un recordatorio más de que la mutación del virus en una persona inmunodeprimida podría crear variantes peligrosas en el futuro. Esto es especialmente urgente cuando se trata de literalmente millones de personas en el sur de África que tienen el VIH y no toman medicamentos.

“El punto no es culpar o estigmatizar a las personas en esta situación, , sino reconocer que ayudarlos es clave para poner fin a la pandemia de coronavirus”, dice Lessells, y concluye: “La intervención aquí es clara. Solo tenemos que fortalecer nuestra respuesta al VIH y lograr que la mayor cantidad posible de personas se sometan a regímenes de tratamiento eficaces”.

|Fuente: www.infobae.com

Alerta mundial: los casos de Covid-19 también aumentan en América

Esta última semana hubo en toda la región 880.583 nuevos casos y más de 15.000 fallecimientos por el coronavirus. Se registraron fuertes picos en Estados Unidos. Canadá, Bolivia, Ecuador y Paraguay.

La Organización Panamericana de la Salud (OPS) advirtió este miércoles que los contagios de Covid-19 aumentaron un 23% en la última semana en toda América, con un total de 880.583 nuevos contagios y más de 15.000 muertes. Una situación que también está ocurriendo en Europa, donde las muertes aumentaron la semana pasada a casi 4.200 por día, el doble de lo que se registró en septiembre.

“Estas tendencias son reveladoras”, dijo en conferencia de prensa la directora de la OPS, Carissa Etienne, advirtiendo sobre el aumento de los positivos, principalmente en Estados Unidos y Canadá. Aunque se registraron fuertes picos también en Bolivia, Ecuador y Paraguay.

Covid-19.

Covid-19.

Sudamérica

Casi todos los países de Sudamérica, excepto Brasil, Surinam y Venezuela, notificaron una mayor incidencia de Covid-19. Pero los saltos más pronunciados se dieron en Ecuador y Paraguay, con un alza de 400% en el departamento boliviano de Santa Cruz, que la OPS atribuyó a las huelgas y protestas recientes, según informó la agencia de noticias AFP.

En Colombia, Bogotá y Medellín reportaron un aumento de contagios y hospitalizaciones, especialmente entre los más jóvenes. Y en Chile y Argentina también se registraron más casos nuevos.

Covid-19.

Covid-19.

Centroamérica

Aunque las nuevas infecciones se redujeron 37% en Centroamérica, hubo un crecimiento en Barbados, las Islas Caimán y República Dominicana. Por su parte, Trinidad y Tobago registró las tasas de coronavirus más altas en toda la pandemia, con al menos cinco hospitales al 80% de su capacidad.

“A pesar de que los casos de Covid-19 han disminuido significativamente en los últimos meses, la transmisión todavía está activa en nuestra región, por lo que cada vez que bajamos la guardia, el virus gana impulso, dijo Etienne, señalando el riesgo que suponen las fiestas de fin de año y las vacaciones de verano.

En este contexto, la directora del organismo sanitario resaltó la situación en Europa, donde los focos de baja vacunación anticovid y una relajación de las medidas de prevención generaron una suba de las infecciones, provocando nuevas medidas restrictivas por parte de algunos gobiernos.

“A lo largo de esta pandemia, Europa ha sido una ventana al futuro para las Américas. Una y otra vez hemos visto cómo la dinámica de la infección en Europa se refleja aquí, varias semanas después”, dijo Etienne.

“El futuro se abre ante nosotros y debe ser una llamada de atención para nuestra región porque somos aún más vulnerables”, agregó.

Covid-19.

Covid-19.

La OPS destacó que en América Latina y el Caribe el 51% de las personas ya están completamente inmunizadas contra el coronavirus mientras que 19 países de la región no lograron aún la meta de la Organización Mundial de la Salud (OMS) de vacunar al 40% de su población para fines de este año.

Y aún así en muchas naciones se levantaron o flexibilizaron las medidas para evitar contagios, como el uso de mascarillas y el distanciamiento social, especialmente en lugares cerrados. “Esta es una combinación preocupante”, afirmó Etienne.

Covid-19.

Covid-19.

Esta última semana hubo en toda América 880.583 nuevos casos y más de 15.000 fallecimientos por el Covid-19.

|Fuente: www.ambito.com

El Ministerio de Salud emitió un alerta por riesgo de reintroducción de sarampión

La cartera sanitaria realizó un comunicado ante la circulación del virus en Brasil y la aparición de brotes en diversos países.

El Ministerio de Salud emitió un alerta por riesgo de reintroducción de sarampión

El Ministerio de Salud emitió un alerta por riesgo de reintroducción de sarampión

El Ministerio de Salud de la Nación emitió una alerta epidemiológica ante la confirmación de brotes activos de sarampión en países de la región y el mundo.

La cartera sanitaria nacional expresó en un comunicado que la circulación del virus en la Región de las Américas continúa activa, ya que en Brasil se confirmaron 619 casos, incluyendo dos muertes en seis unidades federales, mientras que en los Estados Unidos fueron 47 y en la Guayana Francesa, cinco.

Por otro lado, respecto a la vacunación contra el sarampión, desde el Ministerio de Salud instan a la población a verificar que en su carnet de vacunas (tanto de adultos como de niños) tengan el esquema completo y, en caso de dudas, concurrir al vacunatorio más cercano para consultar con el equipo de salud.

Cabe señalar que en julio del año pasado la Argentina volvió a colocarse como un país libre de sarampión luego de un brote de esta enfermedad que había comenzado a fines de agosto del 2019.

|Fuente: www.filo.news

Sudáfrica detectó otra variante de Covid-19

Una nueva variante de Covid-19 fue detectada en Sudáfrica, el país más afectado oficialmente por la pandemia. Científicos trabajan para entender los efectos que podría causar, de acuerdo a lo que confirmó hoy el Instituto Nacional de Enfermedades Transmisibles (NICD, por sus siglas en inglés).

En un comunicado, el organismo puntualizó que se detectaron 22 casos de la variante B.1.1.529 a través de la secuenciación genómica, pero la variante ha provocado una gran preocupación entre algunos investigadores porque varias de las mutaciones pueden ayudar al virus a evadir la inmunidad.

La variante tiene 32 mutaciones en la proteína de pico, la parte del virus que utilizan la mayoría de las vacunas para preparar el sistema inmunológico contra el Covid. Las mutaciones en la proteína de pico pueden afectar la capacidad del virus para infectar células y propagarse, pero también dificultan que las células inmunes ataquen al patógeno.

“Aunque la información es limitada, nuestros expertos están trabajando horas extra con todos los sistemas de vigilancia para entender la nueva variante y cuáles podrían ser sus potenciales implicancias”, dijo el profesor del NICD Adrian Puren.

Sudáfrica fue el primer país en detectar la variante beta el año pasado, una de las consideradas “de preocupación” por la Organización Mundial de la Salud (OMS) debido a que existe evidencia de que es más transmisible y que las vacunas tienen menos efectividad contra ella.

En el país también se detectó otra variante a principios de este año, la C.1.2, pero no desplazó a la delta -la más común en esa nación- y todavía representa un porcentaje muy menor de los genomas secuenciados. Los primeros casos de esta variante se recogieron en Botswana el 11 de noviembre.

|Fuente: www.ambito.com